По отношение на защитените зони за птиците се отлага включването на територии предимно по Черноморието и в Благоевград. Това са Шабленският езерен комплекс, Варненско-Белославското езеро, Дервенските възвишения, Провадийското плато, нос Емине, комплекс Камчия, Дуранкулашкото езеро, Калиакра, Галата, Мелнишките пирамиди, Добростан, Места, Бакърлъка, Рупите, Триград и др.

По отношение на местообитанията се отлага включването на плаж Шкорпиловци, долината на река Батова, Камчия, Дуранкулак, комплекс Калиакра, Палакария, Варненско-Белославския комплекс, Емине, Иракли, част от Среден Пирин и др. Според премиера е технически невъзможно за времето докато тези територии бъдат преразглеждани, да бъдат направени големи строежи в тях. Станишев посочи, че целта е била да се съчетаят интересите и на инвеститорите, и на държавата, която трябва да гарантира запазването на биологичното разнообразие. Приоритет за правителството става разяснителната кампания.

В “Натура 2000” няма да бъдат включени населени места и места с приет подробен устроствен план, функциониращи концесионни площи и места от първостепенен обществен интерес. Целта е да се гарантира, че няма да бъде затруднено изграждането на големи инфраструктурни проекти. НДТ